Композиция цикла стихов напоминает композицию романа, который построен по принципу контрапункта.
Контрапункт – это объединение относительно независимых сюжетных линий, которые сходятся и расходятся между собой и развиваются с разной скоростью.
Принцип контрапункта дает возможность художнику слова отразить картину дисгармонии мира. Но Пастернак нашёл форму не только романного, но и поэтического контрапункта в цикле «Стихи Юрия Живаго». Казалось бы, отдельно развиваются евангельская тема, линия любви, изменения в природе, но в поэзии контрапункт отражает не только общий распад, а и обновляет нарушенную целостность мира. Духовные, социальные, природные связи, которые не могли объединиться в романе, выстраиваются в «Стихах Юрия Живаго». Идея гармонии в противовес разорванным связям очень важна для автора.